美國科羅拉多大學癌症研究中心的團隊在多年前的研究證實，苦瓜的萃取物有抑制乳癌細胞增殖的功效，基於這樣的研究結果，他們現在又有了全新的研究發現，苦瓜還有抑制胰臟癌細胞代謝的能力，並可造成胰臟癌細胞死亡，同樣原理對其他種類癌細胞可能也具有相同功效。 除此之外，苦瓜也可以強化、解毒免疫系統，並除去會造成牙齒傳染病的細菌，也可使體質鹼性化；另外，印度、中國等地認為苦瓜具有改善二型糖尿病的效果。
苦瓜的苦味，來自於其中的苦味素，與苦瓜特有的植化素「苦瓜苷」，苦瓜苷會促進腸道分泌腸道荷爾蒙GLP-1，可刺激胰島素的分泌並有效降低食慾。而苦瓜中的粗纖維、果膠不僅可以解決便祕、刺激腸道蠕動，並能和腸道荷爾蒙GLP-1一起達到幫助控制血糖的效果。
苦瓜具有清熱解毒的功效，能大幅改善因悶熱潮濕產生的濕疹。苦瓜清熱的原因在於其中含有的特殊成分奎寧，這種物質可以抑制體溫中樞的興奮，達到消暑降溫、利尿活血、清心明目的功用。